Fizjoterapia stomatologiczna zajmuje się leczeniem układu stomatognatycznego, czyli stawów skroniowo-żuchwowych, tkanek miękkich twarzoczaszki i układu nerwowego koordynującego ich pracę.  Jest wsparciem w leczeniu stomatologicznym i/lub ortodontycznym.

Nadmierne napięcie w okolicy stawów skroniowo-żuchwowych, które nie jest odpowiednio leczone, może prowadzić do częstych bólów szyi i głowy, a także powodować wady zgryzu, ścieranie się zębów i trudności z otwieraniem ust.

Najczęstsze wskazania do fizjoterapii stomatologicznej:

• bruksizm
• przeskakiwanie w stawach skroniowo-żuchwowych
• zaciskanie, ścieranie zębów
• bóle głowy (napięciowe, migrenowe)
• szumy uszne
• ból odcinka szyjnego
  
• napięcia mięśni twarzy
• przygotowanie i stany po zabiegach chirurgicznych (ekstrakcja zęba, wszczepienie implantu)
• stany po zabiegach ortognatycznych
• przed i w trakcie leczenia aparatem ortodontycznym
• stany po urazie (złamania, zwichnięcia) kości twarzoczaszki
• dysfunkcje nerwów czaszkowych (porażenie nerwu twarzowego, neuralgia nerwu trójdzielnego)